Fue fundada en 1527 bajo la guía de José de Porres, arquitecto opr excelencia de la ciudad colonial.

En realidad se trata de dos construcciones, una detrás con grandes proporciones aún conservada en ruinas y la actual Catedral de San José que vemos frente al Parque Central.

Su construcción dio inicio en 1669 y puesta en funciones para 1680. La categoría de Catedral Metropolitana le fue otorgada en 1743. A la fecha conserva en su interior imágenes de gran valor histórico y religioso como la del Señor Sepultado de San José y de Nuestra Señora del Socorro